Protein–RNA interactions for Protein: Q61475

Cd55, Complement decay-accelerating factor, GPI-anchored, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55Q61475 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd55Q61475 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms