Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsx2Q61412 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vsx2Q61412 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms