Protein–RNA interactions for Protein: Q61194

Pik3c2a, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2aQ61194 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pik3c2aQ61194 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2aQ61194 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms