Protein–RNA interactions for Protein: Q61189

Clns1a, Methylosome subunit pICln, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clns1aQ61189 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Clns1aQ61189 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Clns1aQ61189 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Clns1aQ61189 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clns1aQ61189 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clns1aQ61189 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clns1aQ61189 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clns1aQ61189 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clns1aQ61189 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Clns1aQ61189 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Clns1aQ61189 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Clns1aQ61189 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clns1aQ61189 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clns1aQ61189 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clns1aQ61189 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clns1aQ61189 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clns1aQ61189 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clns1aQ61189 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Clns1aQ61189 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Clns1aQ61189 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clns1aQ61189 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clns1aQ61189 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clns1aQ61189 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clns1aQ61189 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clns1aQ61189 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clns1aQ61189 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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