Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd3Q61060 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms