Protein–RNA interactions for Protein: Q61001

Lama5, Laminin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 3,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama5Q61001 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lama5Q61001 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lama5Q61001 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lama5Q61001 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Lama5Q61001 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Lama5Q61001 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Lama5Q61001 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Lama5Q61001 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Lama5Q61001 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Lama5Q61001 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Lama5Q61001 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Lama5Q61001 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Lama5Q61001 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lama5Q61001 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Lama5Q61001 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Lama5Q61001 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Lama5Q61001 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lama5Q61001 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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