Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Meis1Q60954 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms