Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DbpQ60925 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DbpQ60925 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DbpQ60925 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DbpQ60925 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DbpQ60925 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms