Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Neurod1Q60867 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Neurod1Q60867 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms