Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms