Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Epha1Q60750 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epha1Q60750 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms