Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
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PtprnQ60673 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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PtprnQ60673 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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PtprnQ60673 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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PtprnQ60673 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms