Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms