Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd40Q5SUE8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms