Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms