Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH8

Cyb5d2, Neuferricin, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb5d2Q5SSH8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cyb5d2Q5SSH8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cyb5d2Q5SSH8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms