Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf12Q5SPL2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf12Q5SPL2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf12Q5SPL2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf12Q5SPL2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf12Q5SPL2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf12Q5SPL2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf12Q5SPL2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf12Q5SPL2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf12Q5SPL2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf12Q5SPL2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf12Q5SPL2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf12Q5SPL2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf12Q5SPL2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf12Q5SPL2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf12Q5SPL2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf12Q5SPL2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 358 ms