Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rtp3Q5QGU6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms