Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim58Q5NCC9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms