Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttf2Q5NC05 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms