Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpm3Q5F4S9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpm3Q5F4S9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm3Q5F4S9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms