Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG6

Hspb6, Heat shock protein beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb6Q5EBG6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hspb6Q5EBG6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspb6Q5EBG6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms