Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufaf2Q59J78 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf2Q59J78 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms