Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spag9Q58A65 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Spag9Q58A65 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Spag9Q58A65 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Spag9Q58A65 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Spag9Q58A65 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Spag9Q58A65 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spag9Q58A65 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spag9Q58A65 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spag9Q58A65 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spag9Q58A65 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spag9Q58A65 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spag9Q58A65 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spag9Q58A65 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spag9Q58A65 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spag9Q58A65 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spag9Q58A65 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spag9Q58A65 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spag9Q58A65 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spag9Q58A65 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spag9Q58A65 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spag9Q58A65 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spag9Q58A65 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spag9Q58A65 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms