Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Urb1Q571H0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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