Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrig2Q52KR2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms