Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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