Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Xirp2Q4U4S6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms