Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms