Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnah12Q3V0Q1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnah12Q3V0Q1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms