Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc43Q3V0L5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc43Q3V0L5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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