Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930567H17RikQ3V0K5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
4930567H17RikQ3V0K5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms