Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm44Q3V089 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbm44Q3V089 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms