Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
4933416C03RikQ3V063 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933416C03RikQ3V063 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms