Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnaaf3Q3UYV8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms