Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn13Q3UW68 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn13Q3UW68 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms