Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-Eb2Q3UUV9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb2Q3UUV9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms