Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTW2

A530084C06Rik, RIKEN cDNA A530084C06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530084C06RikQ3UTW2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 CT025579.2-201ENSMUST00000225280 816 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms