Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BB287469Q3UT53 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BB287469Q3UT53 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms