Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B230104I21RikQ3USW4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B230104I21RikQ3USW4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms