Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc190Q3URK1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc190Q3URK1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms