Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rmi2Q3UPE3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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