Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3UPC7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UPC7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UPC7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3UPC7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UPC7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UPC7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UPC7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UPC7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3UPC7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms