Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Yipf3Q3UDR8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Yipf3Q3UDR8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms