Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttll12Q3UDE2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms