Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms