Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA16

Spc25, Kinetochore protein Spc25, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc25Q3UA16 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spc25Q3UA16 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spc25Q3UA16 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spc25Q3UA16 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Spc25Q3UA16 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spc25Q3UA16 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spc25Q3UA16 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Spc25Q3UA16 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spc25Q3UA16 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spc25Q3UA16 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spc25Q3UA16 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Spc25Q3UA16 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Spc25Q3UA16 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Spc25Q3UA16 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Spc25Q3UA16 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Spc25Q3UA16 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Spc25Q3UA16 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Spc25Q3UA16 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Spc25Q3UA16 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Spc25Q3UA16 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Spc25Q3UA16 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spc25Q3UA16 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms