Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtpbp6Q3U6U5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtpbp6Q3U6U5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms