Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms