Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ulk3Q3U3Q1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ulk3Q3U3Q1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ulk3Q3U3Q1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms